故事发生背景略微是在未来了。网络世界「Digimon World」和「Digital Monster」的存在被确认下来。数码世界和数码兽研究的第一人·大门 英(だいもんすぐる)，开始努力探知数码兽的生态，然而通过研究，得知其中有少数的恶性数码兽存在。因此政府为了对数码兽采取对策，设立了「数码世界特别搜查部队·DATS（Digital Accident Tactics Squad）」。大门教授的独生子大门 大(まさる)被物色为DATS的队员，与托马和淑乃(よしの)组成了3人小组，共同对抗恶性数码兽！  

·大门　大（大门　大 CV：保志総一朗）
　 220战不败的打架番长，比起一天三顿饭更喜欢打架的初中生。见到看上去很强的对方就一定要找架打。在与某天遇见的数码兽「亚古兽」的打架中最后获胜，于是便把亚古兽当作小弟。而成为了看中亚古兽的进化潜力的DATS的一员。


·Tohma·H·Norshtein（トーマ・H・ノルシュタイン CV： 野岛裕史）
　　 超级精英！金发的贵公子，14岁就大学毕业了的天才少年。即使在DATS中也有很高的评价的精英。把操作基于数据和理论作为信条，总是跟凭感性行动的大起冲突。是一个爸爸为澳大利亚屈指可数的贵族，妈妈为日本人的混血儿。


·藤枝淑乃（藤枝　淑乃 CV：新垣结衣）
　　　　 认真，机灵，大姐姐！大的队伍的一点红，比大和Tohma的年纪都要大的姐姐。有精明的一面，喜欢支使年纪小的大和Tohma做麻烦的事。因为有很高的能力，得到DATS队伍的信赖。口头禅是「玉の舆」。


·亚古兽(大门大的搭档数码兽 アグモン CV：松野太纪）
　　 与从DATS手上逃脱时遇见的大的打架输掉了，于是喜欢上了大。仰慕大为"老大"一同行动。得意技是从口中吐出的火焰的「小型火焰」，得到大的数码之魂后进化成为Geo暴龙兽。


·加奥兽(Tohma·H·Norshtein的搭档数码兽 ガオモン CV：中井和哉)
　　称呼Tohma为"主人"，忠实地跟随着。和搭档一样杰出的数码兽，性格聪慧外表酷，能够进化成加奥加兽。


·拉拉兽(藤枝淑乃的搭档数码兽 ララモン CV：ゆかな)
　　作为淑乃的搭档的植物型数码兽。有泥浆喷射的得意技。与淑乃超越了人和数码兽搭档的关系，以朋友们一样的信赖感而连结在一起。能够进化成向日葵兽。



萨摩廉太郎（DATS队长）：楠大典
管狐兽：葛城七穂
黒崎美树（DATS操作员）：永野爱
白川　恵（DATS操作员）：埴冈由纪子
迷之垂钓人：长岛雄一
大门小百合：国府田マリ子
大门知香：菊池こころ
警官A：はなわ

DATS（Digital Accident Tactics Squad）
为处理人类世界出现的数码兽的数量的增加问题以及因此造成的受害事件增加的情况而设立的数码兽搜查专门组织。同时也是个行动完全不被世人所了解的秘密组织。由于只有数码兽才能够控制住数码兽，所以他们的任务背负着重大的责任。