《红色警戒2》保留了由多款《命令与征服》系列游戏确立并反复考验的传统游戏结构。与其前款游戏相同，《红色警戒2》包罗了即时战略游戏的几乎全部要素。玩家从等距视角观察游戏进行，此手法被广泛应用于大多数2D即时战略游戏中；在进行游戏时，玩家操控方法也与此前的《命令与征服》游戏别无二致。这一操作程式风韵不减当年--玩家可以易如反掌地选择或移动作战部队，而他们能够自如地游弋于游戏环境中。《红色警戒2》 并未向玩家的作战部队提供任何特殊高级选项--例如，玩家不能以预先设定的队形移动或编排部队，也不能命令部队自动侦察或回营整修等等。但这并不影响大局，因为这些部队的“自主性”体现在一些更重要的方面--无需提醒，他们会自动攻占敌军目标；而且他们对于命令具有非常敏锐的反应，这一点可能应该归功于游戏本身的流畅性。